Создать ярлык
На рабочем столе правой кнопкой мыши, и выбираем "Создать кнопку запуска здесь"

Шаблон .destktop файла

[Desktop Entry]
Version=1.0
Type=Application
Name=Git Extensions
Icon=/opt/GitExtensions/gitextensions.2.49.02.svg
Exec="/opt/GitExtensions/gitext.sh" %f
Comment=The Drive to Develop
Categories=Development;    
Terminal=false
StartupWMClass=jetbrains-idea

Посмотреть StartupWMClass для приложения

xprop WM_CLASS

Папка с ярлыками

~/.local/share/applications/

Папка с настройками Plank

~/.config/plank/dock1/launchers/